1- Ingate o Pendrive no USB

2- Explore o Pendrive

3-No XP:  Vá em "Opções de Pasta" e marque a opção "Exibir pastas e arquivos ocultos"

  No Seven: Vá em Organizar > Opções de pasta e pesquisa e pesquisa > Modo de exibição > e marque "Exibir arquivos e pastas ocultos".

4- Note que apareceram vários arquivos no Pendrive, pode deletar todos! (Shift + Delete)

5- Depois abra o bloco de notas

6- Escreva qualquer coisa, ou deixe em branco mesmo, e salve com o nome: Autorun.inf

7- Copie esse arquivo que você criou para o pendrive (se preferir pode deixá-lo oculto)

8- Prontinho, pendrive LIMPO e VACINADO, além dele não ter mais vírus, também não vai mais pegar nenhum tipo de vírus.